南麂列岛国家自然保护区创建于1990年12月，是国务院批准的我国首批五个国家级海洋自然保护区之一，它是以保护海洋生物多样性为目标，以海洋贝、藻类及其生境为主要保护对象的特定海洋生态系统保护区。1998年12月，该保护区又成为我国唯一纳入联合国教科文组织世界生物圈保护区网络的海洋类型生物圈保护区。